納稅檢查的方法一般有以下幾種：
（1）審閱法和查詢法。審閱法，是通過(guò)查閱憑證和帳目進(jìn)行大量觀察，審查記載是否完備、真實(shí)、合理、合法，借以發(fā)現(xiàn)可疑之處，為進(jìn)一步查證落實(shí)提供線索。查詢法，是通過(guò)當(dāng)面或發(fā)函詢問(wèn)，以取得某些必要的資料，或證實(shí)某些需要進(jìn)一步查清的問(wèn)題。

（2）普查法和抽查法。普查法，是對(duì)被查納稅人一個(gè)時(shí)期的所有會(huì)計(jì)憑證、帳簿和報(bào)表進(jìn)行全面系統(tǒng)的檢查。抽查法，則是為弄清某一問(wèn)題，有目的、有重點(diǎn)地從被查納稅人的憑證、帳簿或報(bào)表中抽出有關(guān)部分進(jìn)行檢查，對(duì)照企業(yè)帳簿記錄，有針對(duì)性地進(jìn)行檢查。

（3）順查法和逆查法。順查法，是按會(huì)計(jì)制度的程序，從檢查會(huì)計(jì)憑證開(kāi)始，以憑證核對(duì)帳簿，再以帳簿核對(duì)報(bào)表來(lái)進(jìn)行檢查的一種方法。逆查法，是從檢查會(huì)計(jì)報(bào)表開(kāi)始，以報(bào)表核對(duì)帳簿，再以帳簿核對(duì)憑證，來(lái)查清問(wèn)題的一種檢查方法。

（4）對(duì)比法和核對(duì)法。對(duì)比法又稱比較分析法，它是將企業(yè)報(bào)表或帳面資料的本期實(shí)際完成數(shù)同企業(yè)的各項(xiàng)計(jì)劃指標(biāo)、歷史資料或同類型企業(yè)的相關(guān)資料進(jìn)行靜態(tài)或動(dòng)態(tài)對(duì)比的一種檢查方法。核對(duì)法，是通過(guò)會(huì)計(jì)憑證、帳簿、報(bào)表以及實(shí)物相互核對(duì)來(lái)檢查帳證、帳帳、帳實(shí)是否相符的一種方法。不論采取上述哪一種檢查方法都要注意把納稅人的憑證、帳簿、報(bào)表及其他活動(dòng)記錄所反映的內(nèi)容聯(lián)系起來(lái)加以對(duì)照檢查。包括納稅單位內(nèi)部的帳與帳、帳與表、帳與證之間的聯(lián)系；以及帳與物、帳內(nèi)記錄與納稅單位內(nèi)部有關(guān)活動(dòng)記錄之間的聯(lián)系。