一、在主要證據(jù)不足、事實(shí)不清的情況下作出行政行為

有的公安機(jī)關(guān)在調(diào)查取證時(shí)對(duì)主要證據(jù)未收集充分，導(dǎo)致最終作出的行政處罰事實(shí)不清；有的城建部門在缺乏法律規(guī)定應(yīng)當(dāng)具備的主要證據(jù)材料時(shí)作出行政行為；有的公安交警部門在適用簡(jiǎn)易程序作出交通行政處罰決定時(shí)未收集必要的證據(jù)，訴訟中不能承擔(dān)相應(yīng)的舉證責(zé)任；

有的民政等登記機(jī)關(guān)未履行審慎合理審查的義務(wù)，在申請(qǐng)人未提供應(yīng)當(dāng)提交的證明材料，或在未審查申請(qǐng)人提交的身份證明材料真實(shí)性的情況下給予辦理登記；還有的工商、房屋登記等機(jī)關(guān)在辦理登記或注銷登記時(shí)，雖已盡合理審查義務(wù)，但申請(qǐng)材料非本人簽名或者申請(qǐng)材料中的部分材料虛假，因受技術(shù)限制無法識(shí)別其真?zhèn)?，?dǎo)致登記或注銷登記行為錯(cuò)誤。

　二、不遵守法定程序或違反正當(dāng)程序作出行政行為

有的國土部門在限期拆除決定尚未作出或縣級(jí)人民政府未責(zé)成有關(guān)部門強(qiáng)制拆除的情況下，直接將違法建筑拆除；辦理劃撥土地的轉(zhuǎn)讓手續(xù)時(shí)，未按程序先行辦理出讓登記而直接辦理轉(zhuǎn)讓登記；辦理土地登記時(shí)地籍調(diào)查在先，申請(qǐng)登記在后，程序顛倒；未經(jīng)聽證程序即核發(fā)房屋拆遷許可證。有的房屋登記機(jī)關(guān)、公安機(jī)關(guān)將行政相對(duì)人要求履行法定職責(zé)的申請(qǐng)，作為信訪處理等；且未履行相應(yīng)的告知義務(wù)；一些行政機(jī)關(guān)違反法律規(guī)定委托送達(dá)相關(guān)法律文書。

　三、不能準(zhǔn)確理解法律規(guī)定或正確把握法律原則，導(dǎo)致行政行為適用法律錯(cuò)誤

有的城建主管部門錯(cuò)誤適用已失效的法律；法律規(guī)定必須并處的行政處罰，有的卻變成單處；對(duì)相對(duì)人作出不利處分時(shí)，不區(qū)分主觀過錯(cuò)情況簡(jiǎn)單適用同樣的裁量標(biāo)準(zhǔn)，導(dǎo)致適用法律錯(cuò)誤；
有的發(fā)展改革主管部門在原項(xiàng)目核準(zhǔn)文件失效后再作出建設(shè)主體變更的行政行為。

四、濫用職權(quán)、超越職權(quán)及不當(dāng)行使裁量權(quán)

有的城建部門在征遷及拆違案件中，或以拆危代替拆違，或以拆違代替征遷；有的直接以“三改一拆辦公室”的名義作出限期拆除通知。有的國土部門無強(qiáng)制執(zhí)行權(quán)而越權(quán)強(qiáng)制拆除違法建筑；有的在縣級(jí)人民政府未作出是否準(zhǔn)許用地的決定前，越權(quán)作出不予許可的“退回決定”，或未經(jīng)有權(quán)人民政府批準(zhǔn)，越權(quán)審批，顯失公正。

　五、不履行或者拖延履行法定職責(zé)

有的市縣人民政府對(duì)相對(duì)人要求履行法定職責(zé)的申請(qǐng)?jiān)诜ǘㄆ谙迌?nèi)不予答復(fù)，或怠于履行對(duì)責(zé)令限期拆除決定進(jìn)行審查并作出復(fù)議決定的法定職責(zé)；有的國土部門不依照征地補(bǔ)償協(xié)議的約定履行行政合同義務(wù)，或?qū)ν恋剡`法行為不履行立案查處職責(zé)，或?qū)Σ疬w安置的用地不履行土地確權(quán)職責(zé)等；有的城建部門未在法定期限內(nèi)給當(dāng)事人作出答復(fù)，或未在法定期限內(nèi)作出處理決定或不履行承諾義務(wù)，或違反法律規(guī)定作出暫緩處理意見，變相不作為；

有的公安、民政部門在接到報(bào)案、投訴舉報(bào)后，雖經(jīng)調(diào)查取證，卻未在法定期限內(nèi)作出明確的處理意見或答復(fù)，或一直未告知當(dāng)事人相關(guān)的查處結(jié)果；有的工商機(jī)關(guān)在接到要求調(diào)解解決消費(fèi)爭(zhēng)議的申訴舉報(bào)后，既未在法定期限內(nèi)進(jìn)行調(diào)解，亦未依法將處理結(jié)果告知相對(duì)人；

除此以外，一些行政機(jī)關(guān)不依法公開政府信息、有的行政復(fù)議機(jī)關(guān)不正確履行復(fù)議職責(zé)、部分市區(qū)級(jí)人民政府違法實(shí)施房屋征收和拆違，以及基層街道政府依法履職能力不足等，也是行政機(jī)關(guān)敗訴的主要原因。