根據(jù)《人民檢察院刑事賠償工作暫行規(guī)定》(1997年11月18日頒布實(shí)施)規(guī)定，人民檢察院在辦理刑事賠償案件中確認(rèn)違法的程序規(guī)則是：

1、視為違法確認(rèn)的情形。在這種情況下，受害人無須單獨(dú)提出確認(rèn)申請，確認(rèn)程序也無單獨(dú)進(jìn)行的必要。

有下列法律文書或證明材料的，應(yīng)視為請求賠償?shù)谋磺謾?quán)事項(xiàng)已依法確認(rèn)：

(1)人民檢察院撤銷拘留決定書、撤銷逮捕決定書、撤銷案件決定書、不起訴決定書、復(fù)查糾正決定書等法律文書，或者公安機(jī)關(guān)撤銷案件予以釋放的證明書、人民法院宣告無罪已經(jīng)發(fā)生法律效力的判決、裁定書等法律文書；

(2)對檢察機(jī)關(guān)工作人員在行使職權(quán)中刑訊逼供或者以毆打等暴力行為或者唆使他人以毆打等暴力行為以及違法使用武器、警械造成公民身體傷害、死亡，作出處理決定的文書；

(3)對采取查封、扣押、凍結(jié)、追繳財(cái)產(chǎn)等措施認(rèn)定為違法的文書。

2、確認(rèn)申請的受理。人民檢察院按照內(nèi)部的業(yè)務(wù)分工，由有關(guān)業(yè)務(wù)部門受理確認(rèn)申請，提出侵權(quán)事實(shí)是否存在的意見，移送刑事賠償工作辦公室。經(jīng)刑事賠償工作辦公室審查并報(bào)檢察委員會決定后，制作《刑事確認(rèn)書》，送達(dá)賠償請求人。

3、申訴。賠償請求人對被要求的人民檢察院不予確認(rèn)的，有權(quán)向其上一級人民檢察院提出申訴。對不予確認(rèn)的申訴，上一級人民檢察院可以自行復(fù)查，也可以責(zé)成下級人民檢察院復(fù)查。對不予確認(rèn)的申訴，經(jīng)復(fù)查認(rèn)定侵權(quán)事實(shí)存在的，予以確認(rèn)；侵權(quán)事實(shí)不存在的，駁回申訴。

請求賠償?shù)谋磺謾?quán)事項(xiàng)經(jīng)依法確認(rèn)后，負(fù)有賠償義務(wù)的人民檢察院應(yīng)當(dāng)依照國家賠償法和有關(guān)規(guī)定及時(shí)進(jìn)行處理。